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高通量|這才是藻類研究真正需要的一款工具!

更新時間:2022-07-26  點擊次數(shù):1224

ROTOR+最初是為芽殖酵母(釀酒酵母)遺傳學而設計。對萊茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)進行大規(guī)模的遺傳篩選,ROTOR+的功能可以發(fā)揮很大的作用。然而,衣藻與出芽酵母菌在細胞大小、生長速度、菌落形態(tài)和粘附性以及光響應性方面存在差異。因此,ROTOR+能否適用于衣藻類研究成為了關(guān)鍵。

因此在測試過程中要解決的下面的問題顯得尤為重要:

Q1:細胞是否通過ROTOR+可靠地從液體或固體介質(zhì)中挑取到RePads復制針板上,在針頭之間、針板之間、不同平板間,細胞的數(shù)量/密度是否可以再生?

A1:可重復性挑取和接種的細胞數(shù)量,取決于細胞的表面特性:有多粘稠,粘附(或被排斥)在瓊脂表面的程度等等。衣藻在這些特性上不同于酵母。例如,在使用絲絨(酵母的標準方法)進行復制時,衣藻菌落有很強的傾向,要么*粘在平板上,要么*轉(zhuǎn)移到絲絨上。

Q2:細胞在此過程中是否保持高活力?

A2:轉(zhuǎn)移的細胞保持高活力顯然是必要的。從我們最初的工作中可以清楚地看出,在許多方面,衣藻在某些操作過程中比酵母菌或大腸桿菌更容易受到損傷。例如,當從瓊脂上挑取到玻璃或不銹鋼針上時,衣藻在空氣中大約40秒后就會幾乎*喪失生存能力。

Q3:針頭之間、源板之間或靶板之間是否有明顯的交叉污染?

A3:根據(jù)生物體的特性,可以很容易地想象,活細胞氣溶膠可以通過ROTOR+復制操作傳播,導致交叉污染和破壞實驗。

Q4:使用ROTOR+可以可靠接種和區(qū)分的菌落最大密度是多少?

A4:菌落可以被接種的最大密度取決于生物體的大小和生長速度,并將影響對生物體進行篩選的通量。

首先通過ROTOR+對液體到瓊脂的轉(zhuǎn)移展開相關(guān)實驗。

用Singer PlusPlates方板,注入50ml的TAP瓊脂(標準衣藻培養(yǎng)基),并添加了50μg/ml氨芐西林來抑制細菌污染。由于衣藻在液體介質(zhì)中具有很強的流動性,對光線也有很強的敏感性,因此需要將ROTOR+上的內(nèi)部光源取下,并在操作過程中盡可能遮擋光線。如果沒有這種預防措施,藻類會在源板的不同區(qū)域強烈聚集,會嚴重影響整個板的菌落再現(xiàn)性。

用一個注入25ml TAP的液體培養(yǎng)基平板,其中含有約10^6cells/ml濕的衣藻(cc-124背景),用384RePad長針,從液體到瓊脂,從384密度排列成1536密度,(針重復利用)。在33°C強光照下培養(yǎng)3天(圖1A),每隔一段時間顯微鏡觀察。

圖1:液體到瓊脂轉(zhuǎn)移

可以看到菌落具有明顯的活力,基本上每個細胞被接種18小時都形成了一個微菌落(圖1C)。平板的圖像顯示了接種區(qū)域的再生性,不同平板之間也觀察到良好的再生性。

另一方面,在這種固定密度下,菌落之間有明顯的空間分隔,中間沒有污染的菌落產(chǎn)生。

ROTOR+從挑取到接種需要5-10秒。為了測定在空氣中RePad上的衣藻活力,在挑取衣藻后和接種前分別暫停0、10、20和40秒,轉(zhuǎn)移的細胞數(shù)量及培養(yǎng)后的活力基本保持不變。從含有50ml細胞懸浮液的SINGER平板中,測試了液體到瓊脂的轉(zhuǎn)移,結(jié)果基本相同,表明了有效液滴大小與針插入的液體深度幾乎無關(guān)。

接下來通過ROTOR+從瓊脂到瓊脂的轉(zhuǎn)移展開實驗。

以含有TAP瓊脂的Singer PlusPlate方板為來源板,上有cc-124背景的衣藻菌膜。使用384RePad長針挑取細胞并轉(zhuǎn)移到新板上,連續(xù)點種16個點,過程中不回到來源板,這形成6144個點,每16個點逐漸稀釋接種物。用顯微鏡檢查這些培養(yǎng)皿,并培養(yǎng)成菌落。

從培養(yǎng)的菌落來看,菌落直徑約1毫米,連續(xù)接種導致轉(zhuǎn)移細胞的數(shù)量逐漸減少,該方法可用于將接種密度降低到孤立的單細胞。瓊脂-瓊脂接種的細胞存活率通常很高,幾乎相當于液體-瓊脂接種。

一般來說,單個細胞和由此產(chǎn)生的菌落和微菌落都停留在由針的幾何形狀決定的空間邊界內(nèi),因為衣藻在平板上是不活動的,而且?guī)缀醪恍枰獓婌F或氣溶膠就可以精確地進行操作。因此,這些程序適用于在有限的空間和耗材里,最大限度培養(yǎng)和轉(zhuǎn)移衣藻。

 

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